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endosome

做生物信息学分析,求 Python 和 R 教程

  •  
  •   endosome May 20, 2016 3398 views
    This topic created in 3629 days ago, the information mentioned may be changed or developed.
    因工作中需要许多 dry lab 的数据分析,因此需要自学 Python 和 R 教程,用于生物大数据分析和文章发表。
    求易于上手的教程或者 textbook 。
    谢谢
    8 replies    2016-05-21 00:09:44 +08:00
    lbp0200
        1
    lbp0200  
       May 20, 2016 via Android
    慕课网有视频
    DaPanda
        2
    DaPanda  
       May 20, 2016
    可以看看 [Python for Informatics]( http://www.pythonlearn.com/book.php) ,专门为以信息处理为目的的 Python 入门教材,很实用。
    yech1990
        3
    yech1990  
       May 20, 2016
    生物有毛线大数据, 不要跟风
    Geeker
        4
    Geeker  
       
    《集体智慧编程》
    《 R 语言实战》
    endosome
        5
    endosome  
    OP
       May 20, 2016 via iPhone
    @yech1990 几千万甚至上亿的序列,手工没法完成吧。实际需要,不是跟风
    yech1990
        6
    yech1990  
       May 20, 2016 via Android
    @endosome 这也就是几百 M 的 reads 。
    分分钟的事,不要扯什么大数据
    endosome
        7
    endosome  
    OP
       May 21, 2016
    @yech1990 咱乡下作坊没有见识过大数据,见过的最大世面就是一个样品做出来几千万几亿的序列。
    以前几百个序列还可以手工操作;对于上亿的序列,我觉得需要写一点 script ,才能完成既定的分析任务。
    在我和我的同事眼里,这就是大数据, big data
    endosome
        8
    endosome  
    OP
       May 21, 2016
    @DaPanda looks cool. Appreciate it.
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