公司开始主动补缴社保了，是有什么大雷么？

背景：

1.公司所谓避税很多年。比如月薪 20k ，按照 10k 给你缴纳社保公积金。到手钱多一些（这事儿不新鲜）
2.行情好的时候大家心知肚明，没把这事儿放心上。
3.最近几年行情不好，陆续有员工委屈离职讨要以前的社保，公司都给补缴了。
4.公司最近在疯狂贷款用来发工资，离职相关核心岗位暗示有一些财务或者业绩上的违规行为。

现状：
1.因为有人要社保这事儿发生，老板上心了。突然叫人事核查所有在职员工以往缺了多少社保，公司出钱补，但是同时个人那部分也要求补缴。
2.老板头疼怎么让员工出钱补缴，有很多老员工补缴要上十几万的那种。老板出的方案：要么我补缴，你也补缴。你不补缴，那签协议放弃，以后离职后不能来要。

疑问：
1.为什么公司突然这么“好心“了？（实际公司付出比个人多很多），公司是在隐藏更大的风险问题么？
2.公司还是怕我们劳动仲裁举报？（私下协商就不会走到举报那步）
3.作为员工该如何应对呢？ 有人不想补钱，也不想签所谓的那个协议。甚至有人提出把补的钱当成裁员遣散费，以后也不找公司麻烦。

阴谋论：公司在疯狂各大银行贷款，打算最后疯狂一波后破产跑路。老板也拿这些贷款给自己发工资，现在之所以开始“正规“，是想在东窗事发之前稳住员工不影响各种贷款事宜。

公司不大，50~60 人，上海
请大家帮忙分析一下公司这么做的愿意以及是否有什么坑？